El proyecto para la creación de la carrera de Ingeniería en Informática, fue introducido al Consejo Nacional de Universidades (CNU) en febrero de 1995 dando a conocer de esta manera al estudiantado la capacidad de innovación y diversidad en esta institución.
Con su fundación, en el año de 1997 se crea la Coordinación de Ingeniería en Informática, contando con la participación de tres profesores y 80 estudiantes. Su primer coordinador fue el Dr. Miguel García. Algunas de las materias del pensum de estudio estaban adscritas al Departamento de Matemática y Sistemas. En 1998 se cambia el nombre de Coordinación de Ingeniería en Informática por Departamento de Ingeniería en Informática.
Posteriormente, en el año 2003 el Dr. Alexander Contreras fue nombrado Jefe del Departamento, ejerciendo este cargo hasta el año 2007. En el período a su cargo, se realizó la primera reforma curricular de la carrera. Entre los años 2007 y 2011, el Ing. Silverio Bonilla ocupó este cargo, formulando adicionalmente el proyecto para la creación de la Maestría en Informática que hoy en día es parte de la oferta de estudios del Decanato de Postgrado de la institución. Para el período 2011-2014 la Msc. María Valero estuvo frente al cargo de Jefe del Departamento, quien en 2014 cedió el cargo al Dr. Froilán Guerrero quien luego de cumplir casi cuatro años como Jefe del Departamento hizo entregaa de su cargo a la Ing. Arlenys Varela.
En la actualidad el Departamento cuenta con equipo profesoral conformado por 35 Ingenieros en Informática, Sistemas, Electrónica y carreras afines.
